水俣市では水俣病の公式確認日（昭和31年5月1日）に因んで、毎年5月1日に「水俣病犠牲者慰霊式」を 開催しています。これは、水俣病の発生によって、犠牲となり亡くなられた方々の慰霊と、環境破壊に対する反省と環境再生への誓いを込めて、全市民で祈りを 捧げることを目的としています。式典には、患者・遺族をはじめ、環境大臣・熊本県知事・国県関係機関代表・チッソ代表や多くの市民が参加し、犠牲者の冥福を祈るとともに、水俣病教訓の継承と水俣再生の誓いを新たにしています。

　平成4年5月1日、水俣湾埋立地にて「第1回水俣病犠牲者慰霊式」開催
　平成9～17年は水俣メモリアルを会場として慰霊式を実施
　平成18年からはエコパーク水俣親水緑地「水俣病慰霊の碑」前を会場として慰霊式を実施